単身、最下層に乗り込んだカイルは＜波動関数収束＞で青悪魔と対峙する。しかし異次元の知能から繰り出される悪辣さに、なす術がない。一方、自ら緊急自衛モードを発動させて『敵（エネミーズ）』の大軍を迎え撃つニィナだが、タイムリミットが迫っていた！　己の全存在を懸け、激突する人類と『敵（エネミーズ）』。生き残り、地球に君臨するのは果たして……！！　そしてカイルの、救世主の正体は！？　『文豪ストレイドッグス』朝…

人類の前に突如現れた生体兵器『敵（エネミーズ）』。その圧倒的な攻撃を受け、世界は壊滅的に蹂躙され、人類の滅亡はもはや秒読みだった‥‥。 しかし、一人の少年が現れ、たった一人で戦地に赴き、世界を救って姿を消す。人類は彼を「救世主」と呼び、その再来を熱望するようになった。 そして３年後、戦闘要塞都市「アラヤシキ」にて記憶喪失の少年・神代カイルが保護される。謎に満ちた少年に襲いかかる『敵（エネミーズ）…

人類の前に突如現れた正体不明の生体兵器『敵（エネミーズ）』。その圧倒的な攻撃を受け、世界は壊滅的に蹂躙され、人類の滅亡はもはや秒読みだった‥‥。 しかし、一人の少年が現れる。彼はたった一人で戦地に赴き、世界を救って姿を消す。人類は彼を「救世主」と呼び、その再来を熱望するようになった。 そして3年後、戦闘要塞都市「アラヤシキ」にて記憶喪失の少年・神代カイルが保護される。謎に満ちた少年に襲いかかる強…

少年圏への潜入捜査中に大切な仲間を失い、悲しみに暮れる「子供たち」。仲間たちを励まし、大人社会へ宣戦布告したシズたちは最後の戦い挑んだ！覚醒したシズは大人たちを追い詰めるが、自らの禁じられた”正体”を知ってしまう！シズの過去とは？子供たちの運命は！？SF青春バトル、ついに完結！

大人達の虐殺から、シズとマチを救ったロボット「ピーターパン」。パイロットのメノが率いる「ネバーランド」で、同じような境遇の「子供達」と出会う。クーデターを起こして大人社会をぶっ潰すことを決意したシズ達だが、大人達の容赦ない追撃が襲いかかる！絶体絶命のピンチに追い込まれたシズは、再び”暴走”をしてしまう・・・!!

その世界では、子供は親を知らず、大人を知らない。まだ見ぬ大人社会に、いよいよ旅立つその日、惨劇は起こった。峻別され、殺されていく少年たち。ごく一部の有能な個体以外が廃棄されていく中、少年たちを救ったのはロボット、「ピーターパン」。この残酷な大人社会を変え、自分たちの尊厳を守るため、少年たちの戦いが幕を開ける！